骷髅宫殿是骷髅篇任务的起点，坐落于热带草原、风袭热带草原和热带高原群系。主体由磨制方解石、切制方解石、涂蜡切制铜块等装饰方块构成。广场地毯的一侧有一个被虫蚀的发光水晶，靠近后触发任务“击碎发光的水晶”。玩家走进大堂则会触发任务“水晶头骨”。

大堂内部两侧的顶层阁楼有2个箱子，内有紫水晶碎片、铜锭等战利品。