生态系宝箱是根据群系自然生成的宝箱，在主世界中最为常见。5.7.1版本开始，将生成柜子而不是宝箱。

生成情况如下：

• 洞窟柜子/洞窟宝箱：天然洞穴中随机生成。

• 地牢宝箱：目前不会自然生成。

• 沙滩柜子/沙漠宝箱：沙漠生物群系随机生成。

• 末地宝箱：目前不会自然生成。

• 地狱柜子/下界宝箱：地狱生物群系随机生成。

• 冰块柜子/寒冰宝箱：雪地生物群系随机生成。

• 树叶柜子/树叶宝箱：树上随机生成。

• 草地柜子/木制宝箱：草地生物群系随机生成。

• 海洋柜子/海洋宝箱：深海生物群系的海底随机生成。

• 天界柜子：目前不会自然生成。

打开生态系宝箱有机会获得金钱、物资、食物，并有概率出现各种生态系对应的饰品，箱子中的食物在被发现前不会腐烂。

玩家关闭生态系柜子时，柜子会自动被破坏，内部物品将成为掉落物。

在以往的版本中，当玩家取走生态系宝箱中的所有物品后，宝箱将会自动消失。