比较所用的匠魂3版本为3.5.3.92，游戏版本1.18.2。
将原匠魂宝典拆为5本（工匠大百科为其余5本内容的综合），出生时附带1本材料与你。6本指导书分别写有不同等级的材料和游戏内容。
工具
移除：铲（有附属）、长剑、西洋剑、煎锅、战斗牌子（开发中）、回旋镖、短弓（有附属）、箭矢、弩箭。
新增：匕首（可放在副手右键攻击）、板斧（纵向连锁砍树、剥皮，攻击伤害非常高，相当于二代的伐木斧）、矿脉锤（小范围连锁采集）。
未来会新增：Spear（矛，相当于三叉戟）、Boomerang（回旋镖，真的可以回旋）。
矿物
移除：阿迪特。
新增：铜（1.18中被原版铜取代，主世界不再生成任何匠魂矿物）。
要知道，虽然匠魂2支持铜、银等多种金属，但本身没有“生成”他们。
制作
模具加工台与部件加工台合并为部件制造台。部件制造台制造部件时，每次消耗一个模具。
工匠砧（工具装配台）需要使用合金块（不是下界合金块）进行合成，而非任何金属块。
新增强化调配台，可以隐形（显形）工具上的强化，还可以提取工具上的强化与附魔至水晶上成为强化水晶，转移至其它工具上。
熔冶
多方块：新增熔化炉、合金炉、熔铸炉；移除焦黑熔炉和工匠储罐。
熔化炉熔炼非成品物品时，熔炼粗矿（包括远古残骸）可获得1锭3粒的对应熔融金属，熔炼粗矿块可获得12锭的对应熔融金属，熔炼金属矿石可获得2锭6粒的对应熔融金属，熔炼宝石矿石（包括紫水晶簇）可获得2宝石的对应熔融宝石，熔炼砖泥可获得2砖的对应熔石。熔化炉的容量只有1080mB，且每个熔化炉中只能存在一种流体。炉中流体可通过浇注口输出。
冶炼炉的冶炼增产改为了熔化炉的熔炼增产。冶炼炉在合金与实体熔炼时现在也会消耗燃料。
合金炉无法对金属进行熔冶，只能提取相邻流体储罐内的液体进行合金，合金后的熔融合金会保留于合金炉内，可通过浇注口输出。
熔铸炉熔铸非成品物品时不会有增产，不过会有副产物。熔铸上限视搭建的大小而定。熔铸炉是唯一能一次熔铸出多种液体的熔炉，例如你可以将焦黑储罐熔铸成8砖焦黑熔石和1块熔融玻璃。熔铸炉内的流体不会合金。熔铸炉也可以像冶炼炉那样用炉内的流体铸造。铸造无需铸模的物品时需要金栏杆与金平台分别在铸件台与铸造盆中起空白金质铸模的作用。
在制作冶炼炉之前，需要先制作熔化炉（微缩冶炼炉），使用熔化炉往铸造盆中的焦黑砖块浇注3锭熔融铜，才能获得搭建冶炼炉所需的冶炼炉控制器。
熔化炉和合金炉的使用方式可参考“匠魂补充 ”，这是一个匠魂2的附属模组，作者是匠魂2、3的作者之一。
部分合金需要更高的温度才能进行合金，需要比熔岩更高温的燃料（烈焰血）。
装备
旅行者套装 ：材料成本低，适合前期使用。
镶板套装：护甲值高，防御槽较多。
黏液套装 ：由末影黏液和浇注一些生物的肢体获得，可以给玩家带来一些特殊的能力。除黏液头颅外，不提供任何护甲值，有大量升级槽。
强化
强化分为五种：升级、能力、防御、灵魂（暂无作用）和无槽位强化。
升级：小型工具初始3个，大型工具初始2个，工具每有一个玫瑰金部件，就可以多一个升级槽。最终可高达15个【小型工具自带3个+玫瑰金部件3个+铭刻、复生、重置、和睦各1个+均衡（升级）1个+镶金4个（工具自带1个能力槽+龙族1个能力槽，全都用于镶金强化）】。匠魂2大部分强化都是升级。升级可以直接提升工具属性。
能力：所有工具初始1个，后续可额外增加1个。顾名思义，可以让工具获得某项“能力”。
防御：适用于盔甲上的强化，可以让玩家更抗揍。
灵魂：暂无具体作用。
无槽位强化：视觉性强化，无实际作用。
毎种强化分别拥有各自的强化方式，具体见强化槽。
杂项
晾干架、肉干、妈妈做的意大利面与褐岩被迁移至自然然而自然 并没有迁移到高版本。
黏液岛（史莱姆岛）、黏树（史莱姆树）大改。
新增两种灯笼焦黑灯笼和焦褐灯笼，可自行注入液体，产生不同的颜色和亮度。
更多生物头颅（如洞穴蜘蛛、尸壳）。
另：匠魂3与其他增加了金属的模组有联动，主要表现为更多的材料。
至于新材料、新配方、新升级、新属性计算的特性，还请各位玩家在游玩过程中自行探索。
