种子，史前自然模组内培育出树苗的另一种方法。使用种子与任意名称中带有dirt的泥土方块可合成对应植物的树苗。

收集无方块树叶的结种子植物的种子：使用Spore and Seed Collection Envelope点击植物的种子结果部分。

收集有方块树叶的结种子植物的种子：破坏树叶时，有概率掉落种子或者果实，果实可直接加工合成为种子。

在方块上看到种子或者果实直接右键单击收获。

收集苏铁类植物种子：苏铁以自然周期产生果锥，右击收获果锥，加工获得种子。

收集其他结球果植物的种子：针叶被打碎时会掉落球果。将球果打碎或者加工可获得种子。

收集有花植物的种子:使用剪刀采集一朵花，右击此花到依旧存在的父植物的花上，为其授粉获得种子。