命令方块是凋灵风暴的核心，在这里是一种以实体形式存在的可以执行命令的方块。

命令方块自然生成于风暴核心，作为“方块”，它拥有坚实的碰撞箱（类似潜影贝）。在一般情况下，命令方块无法受到伤害，只有当玩家使用任意命令工具才能对它造成破坏。由玩家或者命令方块放置的命令方块实体无法被任何非指令攻击破坏。无论何种命令级武器单次攻击都固定对命令方块造成16点伤害。它拥有64点耐久值，玩家仅能使用命令工具对其造成4次损坏才能使其破坏。

每损坏一次命令方块，命令方块就会带着其所在的平台上升。上升期间命令方块无敌，且平台会从方块变为不可踩踏的实体。上升完成后，命令方块才会采取措施。完成后发出“命令方块：失活”的音效。此后命令方块才可再次被攻击。所以玩家每对命令方块造成一  次损坏后必须立刻离开平台，否则除了掉下内部空间之外还可能被旁边的触手拍死

特殊地，在命令方块生成凋灵共生体后(Mod版本3.0+)及命令方块激活风暴内颅后，命令方块进入防御状态。防御状态下，命令方块周围的6个触手会蜷缩并“包裹”命令方块。此时命令方块无敌。直到凋灵共生体死亡或风暴内颅眼睛破碎后，命令方块才解除防御状态。

在命令方块无敌时攻击它会产生“命令方块：防御”的音效。

命令方块在每次上升完成后，都会尝试在风暴核心中尝试生成以下生物：Sickened Chicken、Sickened Cow、Tainted Slime、Sickened Pillager、Sickened Villager、腐化僵尸、腐化骷髅、腐化蜘蛛、腐化苦力怕。特殊地，第一次攻击后，命令方块会激活风暴触须；第二次攻击后，命令方块会尝试生成凋灵共生体；第三次攻击后，命令方块会激活风暴内颅且会尝试生成Sickened Phantom和Sickened Iron Golem。

命令方块生成生物需满足原版刷怪机制中对刷怪方块的限制，只能在如上半砖、实体方块这样的可刷怪方块上生成，而无法在下半砖、水等不可刷怪方块上生成。这可能会导致命令方块生成生物失败。如果将整个风暴核心的地面用不可刷怪方块替代，则整个内部战过程中命令方块将无法生成任何生物(刷怪尝试全部失败)，包括凋灵共生体和Sickened Phantom。若第二次攻击后凋灵共生体生成失败，则命令方块不会进入防御状态。但风暴核心那崎岖的地面就仿佛是为了防止玩家逃课而设计似的

使用指令直接破坏凋灵风暴体内的命令方块实体并不会使凋灵风暴的死亡。这不合理

注：

1. 当击打体内命令方块并且造成损伤时，会使外界凋灵风暴的部分牵引光束失效、闪烁。

2. 命令方块周围的6个触手为独立的实体，但随命令方块运动而不随平台运动

3. 若命令方块上方有船，则命令方块本体无法正常上升，但平台仍可以正常上升。这会导致命令方块被卡在Hardened Flesh Block中。此时，除非 Hardened Flesh Block 被摧毁，否则无法正常攻击到命令方块。