进化系统用于模拟寄生体在不断的吞噬和击杀生物的过程中变得更加强壮，获得更多技能的过程。该系统可以帮助寄生体在较低的演化阶段的情况下获得一些较高等级的寄生体。
当聚生地存在时，进化系统将可以逆向进行：当寄生体生命值达到0之后，它们将按照进化系统逆向退化为上一级生物，而不是死亡，直到它们无法再退化（移动肉块不能退化为同化种生物）。
IV 阶寄体召唤柱将省略繁杂的进化过程，直接利用进化闪电让同化种生物（不包括被同化的末影龙），原始种寄生体，行走头颅发生进化。
进化线路
先天种进化线路
在演化阶段0时，会生成一种小型的、像蛆一样的寄生虫：虫灵，它们会尝试躲避一切对它们有威胁的生物。
虫灵经过足够的时间成长后，它们就会进化为裂兽，裂兽会把它们发现的任何非寄生体的生物作为目标。通过攻击生物直接转变或给予他们寄巢之唤 II 效果，将这些生物转变为同化种生物或者感染者。
若裂兽积累30点击杀计数后，它将进化为凶裂兽。
适应种进化路线
正常生物→同化种→移动肉块→原始种→适应种：
当正常生物感染寄巢之唤后，它们将不可逆的向寄生生物转变。这些寄群之唤感染者能够伪装成正常的生物，并向附近的生物传播寄巢之唤效果，扩散感染。若有对应的同化种可以转化的话，它们在一定条件下可以转变为对应同化种。
少数没有伪装的同化种生物有可能发生进化，当它们杀死5个生物，并且附近还有3个同化种生物（包括被同化的牛，被同化的羊，被同化的狼，被同化的猪，被同化的人类，被同化的村民，被同化的冒险者，被同化的马），它们就会融化形成移动肉块，并合并形成目前可用的原始种寄生体之一（除原始吞噬兽外）。
原始种寄生体在积累10点击杀计数后（如击杀生物，被闪电击中），可以进化成对应适应种寄生体。
粗制种进化路线
狂化种进化路线
同化种→狂化种
有对应狂化种的同化种生物在获得60点击杀计数后，可以进化为狂化种。（受融合系统影响，在默认配置下无法进化）
特殊转化路线
这些路线不属于进化系统，不受到寄生虫种群以及寄体召唤柱的增益。
被感染者→未转化完全状态：
这些感染者未能成功转变为同化种生物，而是进化的失败品，它们将失去进化的能力，在被杀死时也不能退化。
在SRP V1.9.8后，未转化完全状态（中）会和行走头颅合并为对应的同化种。（被同化的末影龙的头除外）
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