轨道是MTR模组的核心，列车可以在轨道上行驶。
使用轨道连接器右键两个轨道节点即可创建一段轨道，轨道的末端可以继续连接下一段轨道，使用轨道移除器即可移除轨道。
船节点也可使用轨道。
一个轨道节点可以连接多段轨道作为转向。
目前共有十二种轨道：木制、石制、绿宝石制、铁制、黑曜石制、烈焰、石英制、钻石制；特殊轨道有：站台、侧线、掉头；以及用于缆车行驶的缆车缆绳（缆车缆绳需使用缆车节点和缆车站节点连接）。
不同材质的铁轨会对列车的最大速度有所限制，另外三种是创建列车路线的工具。每种铁轨的物品图标上会详细标注它们的速度限制。
当玩家手持轨道相关物品时，轨道将显示轨道类型和信号颜色。
另外，每种铁轨连接器还被分为普通和单向两种形式，单向铁轨可以限制列车的的方向，在列车无故掉头行驶或行驶方向错误时限制列车的方向。
各铁轨类型和最高速度
| 铁轨类型 | 最高速度 |
| 木制轨道 | 20km/h |
| 石制轨道 | 40km/h |
| 绿宝石制轨道 | 60km/h |
| 铁轨 | 80km/h |
| 黑曜石制轨道 | 120km/h |
| 烈焰轨道 | 160km/h |
| 石英制轨道 | 200km/h |
| 钻石制轨道 | 300km/h |
| 缆车缆绳 | 30km/h（直线） 5km/h（曲线） |
钻石的虽然快，但是太贵了，需要6个钻石块
