鳞翅目昆虫学家箱子，顾名思义，是可以且仅可以储存蝴蝶、幼虫和蝶蛹的箱子。

一个鳞翅目昆虫学家箱子可以储存5×5×5=125只蝴蝶、幼虫或蝶蛹。其基本界面如下图所示。

当把鼠标移动至未被分析过的蝴蝶、幼虫或蝶蛹位置时，会显示出如下信息（以黄蛾蝴蝶为例）：

当把鼠标移动至已被分析过的蝴蝶、幼虫或蝶蛹位置时，会显示出如下信息（以黄蛾蝴蝶为例）：

这时，按住shift键，我们可以看到如下内容：

这样，鳞翅目昆虫学家箱子就可以显示出某只蝴蝶、幼虫或蝶蛹的具体信息。

需要注意的是，合成表中的蝴蝶（而不是幼虫或蝶蛹）种类可为任意种类，玻璃也可为任意颜色或透明的玻璃（但不能是玻璃板）（对于防爆玻璃等其他模组的玻璃是否能够合成，暂无资料）。