进化是发生在宝可梦身上的一种现象。当满足一定条件时，宝可梦会开始进化，可以通过点击取消按钮停止进化。进化后的宝可梦的外形、种族值、能学习的招式都会有所不同，有些宝可梦进化后甚至还会改变自身属性。当宝可梦携带不变之石时，宝可梦不会进入进化状态。有些宝可梦的进化条件会是不同条件叠加在一起的，通常来说需要都满足。

• 升级进化

大多数的宝可梦会随着等级的提升开始进化，取消之后下次升级会再次开始进化。满级的宝可梦如果还想要升级进化的话，可以通过食用神奇糖果来触发进化状态。

例如：绿毛虫7级会进化成铁甲蛹；铁甲蛹10级会进化成巴大蝶。

• 亲密度进化

部分宝可梦在亲密度达到一定数值（往往是220）时，下次升级时会开始进化，这种情况通常称之为亲密度进化。

例如：皮丘在220亲密度以上时升级会进化成皮卡丘；属性：空在220亲密度以上时升级会进化成银伴战兽。

• 时间进化

部分宝可梦在特定的时间升级才能进化。

例如：冰雪龙39级之后在夜晚升级进化为冰雪巨龙；猫鼬少20级之后在白天升级进化为猫鼬探长。（与宝可梦原作不同的是，岩狗狗在黄昏进化为鬃岩狼人-黄昏的样子，并不存在特性为我行我素的特殊岩狗狗）

• 性别进化

部分宝可梦只有特定的性别才能进化；也有部分宝可梦不同的性别会进化为不同的宝可梦。

例如：只有雌性的三蜜蜂才能在21级之后升级进化为蜂女王；只有雌性的夜盗火蜥才能在33级之后进化为焰后蜥。

• 招式进化

部分宝可梦只有在持有特定的招式后才能在升级时进化。

例如：甜舞妮在学会踩踏之后会进化为甜美冷后；毒贝比在学会龙之波动后会进化为四颚针龙。

• 地形进化

有些宝可梦在特定的地形或者特定的方块周围内升级才会开始进化。

例如：虫电宝在山地地形升级后会进化为锹农炮虫；好胜蟹在冰岩附近升级会进化成为好胜毛蟹。

• 携带道具进化

有些宝可梦携带特定的道具后升级才会开始进化。

例如：狃拉携带锐利之爪后在夜晚升级会进化为玛狃拉；天蝎携带锐利之牙后在夜晚升级会进化为天蝎王。

• 同行进化

目前只有两只宝可梦使用到了此进化方式。小球飞鱼在队伍里有铁炮鱼时才会在升级后开始进化；顽皮熊猫在32级之后且队伍里有其他恶系宝可梦时才会在升级后开始进化。

• 通讯进化

部分宝可梦需要通过通讯交换进行进化，使用宝可梦交换机与其他玩家可以进行通讯交换。交换后，满足条件的可通讯进化宝可梦会在另一个玩家那边开始进化。

例如：鬼斯通通讯交换会进化为耿鬼；小嘴蜗和盖盖虫通讯交换会分别进化为骑士蜗牛和敏捷虫。

• 使用道具进化

一些宝可梦需要对其使用特定道具才能进化，大多数进化用的道具是类似于火之石、雷之石之类的进化之石。

例如：对卡蒂狗使用火之石后会进化为风速狗；对皮卡丘使用雷之石后会进化为雷丘。

• 分裂进化

目前只有一只宝可梦使用到了此进化方式。土居忍士在进化为铁面忍者时，如果背包里有精灵球且同行宝可梦有至少一个空位时，会消耗一个精灵球额外进化出一只脱壳忍者。

• 随机分支进化

目前只有一只宝可梦使用到了此进化方式。刺尾虫在7级的时候会随机进化为盾甲茧或甲壳茧。

• 属性进化

目前只有一只宝可梦使用到了此进化方式。无畏小子在20级时会根据自身属性来选择分支进化的方向，攻击＞防御会进化为飞腿郎，攻击＜防御会进化为快拳郎，攻击=防御会进化为战舞郎。

• 天气进化

目前只有一只宝可梦使用到了此进化方式。黏美儿在雨天会升级进化为黏美龙。

• 性格进化

目前只有一只宝可梦使用到了此进化方式。毒电婴在30级以上时升级会根据自身的性格决定进化后的形态，如果是勤奋、固执、乐天等等外向型性格则会进化为高调形态的颤弦蝾螈，如果是怕寂寞、内敛、慢吞吞等等内向型性格则会进化为低调形态的颤弦蝾螈。

• 击中要害进化

目前只有一只宝可梦使用到了此进化方式。伽勒尔形态的大葱鸭在一场对战中触发三次击中要害且胜利后，会进化为葱游兵。

• 抗伤进化

目前只有一只宝可梦使用到了此进化方式。哭哭面具在沙漠神殿内战斗时，受到了不低于49的HP损耗且胜利后，会进化为死神板。

• 高度进化

目前只有一只宝可梦使用到了此进化方式。好啦鱿在30级以上，并且玩家高度大于或等于127时会进化为乌贼王。

• 旋转进化

目前只有一只宝可梦使用到了此进化方式。小仙奶在玩家旋转360度后，对小仙奶使用糖饰，并根据时间和群系的不同，依据下表进化为不同形态的霜奶仙。

	黎明 草莓糖饰	上午 花朵糖饰	夜晚 星星糖饰	黄昏 四叶草糖饰	下午 蓝莓糖饰	午夜 蝴蝶结糖饰	白天 爱心糖饰
桦木森林 奶香香草
针叶林 奶香红钻
丛林 奶香抹茶
积雪的针叶林 奶香雪盐
黑森林 奶香柠檬
森林 奶香薄荷
巨型针叶林 焦糖综合
峭壁+(8.4.2之前)/风袭丘陵(9.0.0之后) 红钻综合
蘑菇岛 三色综合
任意群系 异色