自交药水可以使处于求爱模式中的动物繁殖出一个由母体基因重组的后代(或者可以看成两个母体的克隆作为亲本繁殖出来的后代)。要注意的是,由于亲本的所有基因型完全相同,繁殖出来的后代全都是近交的(Inbred),所以会有严重的近交衰退(Inbreeding Depression)。
使用前,请先用对应的作物喂食目标动物(如喂小麦给羊)使其进入求爱模式。然后对目标动物使用自交药水的喷溅型、滞留型、或者对应的药水箭。当自交进行时,动物会跳跃几下,之后生出个幼体的后代。
自交药水可由苹果与任一基础药水(粗制的药水、平凡的药水、浓稠的药水)进行酿造而来。