裂变反应堆与玩家交互的接口。右键可以打开其GUI红色框：放置将要用于燃烧的核燃料，1.7.10为燃料与空单元合成的对应燃料棒。

黄色框：燃烧结束后，生成相应的枯竭核燃料，1.7.10为对应枯竭燃料棒，可以进行燃料回收来获得制取高级核燃料的材料。

绿色框：显示现在正在燃烧的核燃料。

蓝色框：目前反应堆内部放置的反应堆单元数量。

紫色框：发电量以及产热量。一般来说，只有负产热才是绝对安全的。

当裂变控制器被红石信号激活时，反应堆才会工作。在未通红石信号时打开GUI并放入核燃料，可以预览反应堆的发电量与产热量。

反应堆产生的电力从裂变控制器或裂变堆端口输出。（1.7.10只能从控制器中输出）

此外，当反应堆外壳不完整时，裂变控制器也会提示缺失方块的坐标。（1.7.10不支持）

在GUI中，开始运行后会有一个热量条，如果满了就会导致部分冷却器与反应堆单元熔毁，如果切断红石信号，那么就不再产热而冷却器仍然工作，也就是只有散热。

也就意味着，正产热的反应堆为了安全运行，需要时不时的关机。

可以使用原版红石比较器检测其中的信息，当净产热量为负的时候，此时比较器检测的是电量缓存比例，当净产热量为正时转换为检测热量条。

使用红石比较器检测热量条的长度时，当热量到达总量的一半时比较器将会输出信号强度为15的红石信号，无热量时则不输出。由此即可进行一些简单的自动化进行控制防止熔堆。