大多生成于花岗岩岩层，有两种磷灰石矿石，一种颜色为黑色的磷灰石矿石化学式为Ca5(PO4)3F5，是氟气的来源之一，另一种颜色为蓝色的磷灰石矿石化学式为Ca5(PO4)3Cl5，电解后产出氯气。