天境二被重写的恐鸟蛋，和天境初代具有一定的区别。

现在，野生恐鸟只会在它们的巢穴中生成。这也就意味着玩家获得恐鸟蛋的方式有所改变：现在玩家需要趁成年恐鸟不注意前往它们的巢穴里偷取恐鸟蛋。一旦过程被成年恐鸟发现，则恐鸟会对玩家产生敌对行为，并攻击玩家，造成2点（）伤害。和初代天境一样，天境二的恐鸟蛋也有多种颜色形式，这决定了它们能孵化出的恐鸟种类的不同。

在天境二中，玩家还可以得到一种名为彩虹恐鸟蛋的变种恐鸟蛋，这种恐鸟蛋可以随机孵化出各种颜色的恐鸟。但是截至目前，这种特殊的恐鸟蛋只能在创造模式下获得。

天境二中的恐鸟驯养系统和天境初代大体相同，但也有相当的不同处：玩家现在需使用神能晶块作为孵化器的能量来源；推荐玩家需使用专门的恐鸟饲料来喂养恐鸟；且骑乘恐鸟现在需要专门的鞍鞯。

总之，因为模组尚处于测试开发阶段，天境二的新版恐鸟系统其实还远没有天境往事完善。